Sean Barkers Körper wird von einem Alien beherrscht: GUYVER. Da er die unbekannte Macht, die nun in seinem Inneren lebt, nicht versteht, sucht Sean ständig nach der wahren Identität von Guyver. Dabei gerät er plötzlich in die Fänge der Kronus Gesellschaft, einem korrupten Alien-Imperium. Kronus ist seit langem auf der Jagd nach Guyver, um sich mit diesem Super-Alien die Alleinherrschaft auf der Erde zu sichern. Aber Sean gelingt es, mit seinen übermenschlichen Kräften das Böse abzuwehren. Er nimmt es mit den stärksten Aliens auf. Bis es plötzlich zu einer mörderischen Konfrontation kommt. Ein zweiter, grauenerregender Guyver taucht auf, der stärker ist als Sean! Der ultimative Kampf der Alien-Giganten beginnt…